导语自年以来,CRISPR-Cas系统被广泛应用到生命科学研究各个领域中,短短几年内,CRISPR-Cas技术凭借其强大的功能及便捷性,迅速席卷了整个生命科学研究领域,并且掀起了一场革命性的巨变。科学家们借助该技术能以前所未有的精度及速度,对各种生物体的DNA作出编辑。
4月12日,ScienceAdvance杂志在线发表了一篇标题为“CRISPR-Cpf1correctionofmusculardystrophymutationsinhumancardiomyocytesandmice”的研究论文,首次报道了利用CRISPR-Cpf1在人类细胞和疾病模型小鼠中实现高效的基因修复。
CRISPR家族新成员—Cpf1蛋白
虽然近几年CRISPR-Cas赢得盆钵盈满,但在将其推向人类疾病治疗临床应用过程中依然存在一些问题,例如传递方式和效率,脱靶效应及同源重组效率等。因此,许多科学家仍致力于不断完善CRISPR-Cas技术,以达到在疾病治疗中广泛应用的目的。
年4月:麻省理工学院Broad研究所张锋研究小组在Nature杂志公布了一项研究成果,其研究团队在金黄色葡萄球菌中发现了一个更小版本的Cas9—SaCas9。这种小号Cas9酶能更容易地进入细胞,并能降低Cas9体内传递的难度,而这些问题恰是目前spCas9应用的瓶颈所在。虽然SaCas9相对于SpCas9在病毒载体递送方面体现了优势,但其更长且复杂的PAM序列(NNGRRT)限制了它在基因编辑中的运用。
年9月:张锋及其团队又公布了一项振奋人心的新发现—CRISPR家族新成员Cpf1蛋白。这是一种来从Acidominococcus和Lachnospiraceae菌属中筛选得到的新型导向RNA∶DNA内切酶复合物,可能克服CRISPR-Cas9系统应用中的一些限制,实现更高效安全、精确简单地编辑基因。
张锋指出:“尽管CRISPR比之前的基因编辑方法要简单得多,但是该技术依然存在一些不容忽视问题,尤其是应用到人类疾病治疗中,所以我们一直在优化,甚至寻找能更好地替代CRISPR-Cas9的新技术。”
Cpf1和Cas9相比具有哪些特点
Cpf1的发现和应用为CRSIPR基因编辑技术再添热度。作为一种新的CRISPR家族蛋白,Cpf1既拥有DNA切割功能,同时还展现出许多不同于Cas9的特性,而这些特性也使Cpf1被认为有可能替代目前的Cas9技术,或至少丰富CRISPR系统在转化医学中的应用。以下是Cpf1相比于Cas9所具有的特点:
第一,GuideRNA不同。Cpf1介导切割时仅需一条较短的单链CRISPRRNA(crRNA)来引导,而Cas9介导切割时则需要crRNA和反式激活crRNA(tracrRNA)的杂合链来引导,因此Cpf1在结构上比Cas9要简单,便于在组装构建。此外Cpf1蛋白小于SpCas9蛋白,这使Cpf1蛋白更易导入细胞和组织中发挥作用。
第二,切割位点不同。Cpf1介导的切割位点远离PAM序列,而Cas9通常被认为在靠近PAM序列的3和4位间发生切割,这种差异使得人们对于编辑位点有更多选择。
第三,切割机制不同。Cas9介导切割后产生的是平末端序列,Cpf1介导切割后产生不对称的粘性末端序列,而粘性末端序列被认为能够更高效地激活同源重组修复机制。
第四,PAM序列不同。Cas9识别富含鸟嘌呤的PAM序列,而Cpf1识别富含胸腺嘧啶的PAM序列,这一特性扩大了CRISPR技术的靶点的选择范围。
第五,RNA切割功能。年4月,来自德国Max-Planck感染生物学研究所的研究人员证明Cpf1能够独自地对crRNA前体进行切割加工,然后与成熟的crRNA结合并切割DNA,该成果发表于Nature杂志。
第六,脱靶效率极低。年6月NatureBiotechnology在线刊登了Jin-SooKim等人关于Cpf1的研究成果。该研究利用Digenome-seq分析方法在全基因组范围内对比人类细胞中的Cpf1和Cas9脱靶效应,结果证明Cpf1具有高度特异性,几乎没有脱靶效应。
Cpf1介导双链DNA切割的原理
—ZetscheB,etal.Cell.;(3):-71
Cpf1在基因编辑方面的应用
Cpf1由于具有不同于Cas9的特性,自被发现起始就备受研究人员北京中科皮肤医院好不好北京哪家医院治疗白癜风病好