本周分享文献:Sequentialtargetedexomesequencingofpatientsaffectedbyunexplainedlimb-girdleweakness，于年6月11日发表在GeneticsinMedicine(IF=8.)上。现笔者就带大家一起来揭开这篇文章的面纱。

伴有肢带肌无力(Limb-girdleweakness，LGW)的遗传性肌肉疾病是高度异质的罕见神经肌肉疾病(Neuromusculardisorders，NMD)。患者除了表现出典型的进行性骨盆和肩带肌无力外，其他临床特征可能包括呼吸功能不全、心肌病、挛缩和胃肠道并发症等，这些症状降低了个人的生活质量并可能缩短患者的预期寿命。此外，这些神经肌肉疾病的临床和遗传异质性使得遗传诊断颇具挑战。

本项目建立了一个国际合作组织(MYO-SEQ)，旨在帮助肌肉疾病患者并更好地了解肌肉疾病病因。本研究从多达40家肌肉疾病转诊中心中收集了例未进行遗传诊断的患者，并对其进行靶向外显子测序，共检测了个与肌肉状况相关的基因。

本研究收集了例患者(来自个家庭的位男性(54％)和位女性(46％)，大部分患者是欧洲或中东血统)，首先分析了个常见NMD致病基因上的罕见致病变异，然后进一步分析了与罕见肌肉疾病相关的个基因。

患者结果解读

◆个基因解读结果

47％(/)的患者被发现在72(72/)个基因中携带已知或疑似致病的罕见变异。MYO-SEQ队列中最常见的疾病是钙蛋白酶3相关的肢带型肌营养不良隐性1型(LGMDR1)。CAPN3、DYSF、ANO5、DMD、RYR1、TTN、COL6A2和SGCA这8个基因的致病变异可解释例已解决病例中的例，其余例(/)在64个基因(64/72)中均检测出疑似致病变异。

◆个基因解读结果

将基因筛查扩展至(+)个相关致病基因，总共有49％(/)的患者发现在87(87/)个基因中携带已知或疑似致病的罕见变异。EGR2、DYNC1H1、HSPB1、HSPB8、PRPS1和MME被发现和神经病变相关，HURNPA1、INPP5K、TMEM8C、TTR与表现为肌无力的多系统疾病相关。

详见原文Table1从MYO-SEQ队列中鉴定的携带

疑似致病变异的基因

◆CNV解读结果

在3％(26/)的患者中检测到疑似致病CNV，其中17例患者在常染色体隐性基因(DYSF、SGCA、SGCB、SGCD、SGCG、LPIN1)和X连锁基因(DMD、EMD、FHL1)上发生纯合缺失。8例患者携带杂合CNV以及同一基因上的疑似致病SNV。1例患者表现出显性肌原纤维肌病表型，进一步通过全基因组测序及RNA测序，鉴定出携带DMD基因的内含子杂合缺失。

共鉴定出多种新的疑似致病变异

总共鉴定了个基因中的个SNVs和Indels，这些变异最有可能导致例患者患病，其中有种新的疑似致病变异。在这些新变异中，在本研究的患者群体中仅出现一次的有种，多次出现的有种。

详见原文Figure3疑似致病变异的分类

其他病例解读

◆常染色体显性遗传纯合变异病例

一个来自近亲血统的先证者携带已知VCP基因上的纯合子显性致病变异(c.GAp.[ArgHis])，杂合体母亲无疾病症状，杂合体父亲表现出疾病症状。另一个先证者携带了FLNC基因的一个新纯合子变异(c.CGp.[ProArg])，杂合体父母临床上均未受到影响。

◆常染色体隐性遗传杂合携带突变病例

在未解决的病例中，发现有25例杂合携带者携带四个最常见的隐性致病基因(CAPN3：13例,ANO5：9例,SGCA：2例,DYSF：1例)中的16个致病变异，且患者组携带率高于对照组，可能存在未知的第二种隐性致病变异。

①本研究建立了一个国际合作组织MYO-SEQ，以帮助肌肉疾病患者进行检查并更好地了解疾病病因，加快肌肉疾病的遗传诊断。

②在52％的患者中发现了87个与肌肉疾病相关基因中的致病及疑似致病变异。共发现个新变异，其中CAPN3、DYSF、ANO5、DMD、RYR1、TTN、COL6A2和SGCA基因上的致病变异占已解决病例的一半以上。另外还发现了新致病基因，如BVES和POGLUT1。其余48％的未解决患者需要进一步调查。

③本研究结果表明外显子组测序可用于检测遗传性肌肉疾病患者的致病变异，建议首先